La bio-informatique : l'informatique au service de la vie
Extrait d'une de mes conversation type : [...] et sinon tu fais quoi dans la vie / comme études / à paris (rayer la mention inutile ;-)) je fais un master de bio-informatique ah ouais ok... euh... et c'est quoi la bio-informatique ?!
Pour info, actuellement c'est ce qui se passe en Chine qui est devenue la poubelle éthique du monde occidental...
Salut,
A propos de bio-informatique j'ai travaillé sur les biopuces et c'est vrai que c'est révolutionnaire mais c'est uniquement la dernière étape d'un long et dur travail!! Et oui avant d'avoir de beaux résultats, il faut passer par un tas de logiciels de traitements d'images, il faut avoir des bases de données puissantes pour stocker des millions de données, données en plus très sensibles... Il faut savoir communiquer avec des chercheurs, médecins mais aussi des administrateurs réseau/système etc... En plus du côté technique de la profession, il faut avoir un excellent relationnel et être très pédagogue pour pouvoir dialoguer avec ces différentes personnes.
Du coup de la bio-informatique je suis passée à l'informatique côté développement web ;) pour perfectionner le côté technique ;)
Bon courage à toi ;)
Fatiha
Ps : j'ai fait un master en bioinformatique à l'EBI (Ecole de biologie Industrielle), avant ça j'ai eu une maîtrise de biochimie à Paris VI ;)
D'après toi, la bio informatique nous mêne t'elle dans la philosophie des transhumanistes ?
Vouloir développer l'informatique? pourquoi pas. Mais à quoi sert-elle aujourd'hui si ce n'est au contrôle des travailleurs et de leur productions afin de les exploités toujours plus vite, toujours mieux?
Je n'ai pas une peur de la machine en elle même, je sais très bien comment celà fonctionne, je ne suis pas bardé de diplôme, mais j'ai passé mon BAC PRO MRIM (Micro-informatique, Réseau, Installation et Maintenance) et j'utilise Ubuntu. Je vois malheureusement que l'informatique c'est la destruction écologique (sais tu ce que recquiert un ordinateur pour sa production? La quantité de minerai et d'eau qu'il faut? Le transport et donc la consommation de pétrôle?).
Il serai pourtant intéressant de monter une recherche qui tente de faire un outil informatique qui consomme peut d'électricité (surtout quand celle ci est nucléaire), et qui soit orienté vraiment multi-utilisateur afin de ne pas cloissoner les gens chez eux, et un O.S (l'avenir peut-être de certaine version minimaliste de Linux?) qui au lieu de dépenser toujours plus en Mémoire et en processeur tente au fur et à mesure de son évolution de faire mieux avec moins...
Mais je n'ai malheureusement pas encore vu qq.chose dans le genre.
Qu'en penses tu?
@Fatiha : il est possible que j'emprunte cette voie aussi, en tout cas c'est celle qui m'offre le plus de débouchés actuellement.
@Bug-in : répondu sur www.biologeek.com/journal...
Bilan sur la bio-informatique
Ma formation se termine et après deux années de bio-informatique, j'ai acquis un peu plus d'expérience dans le domaine d'où une révision des précédents billets. Ce billet sera aussi l'occasion de faire un bilan sur ma formation et ses perspectives.
La question du reproductif peut être considéré comme à présent résolut, si l'activité humaine de collecte et d'élaboration des savoirs tend à alimenter un récepteur/collecteur "supérieur", la question qui restera posée me semble être: le rêve est-il inhérent au vivant? un récepteur/collecteur supérieur "peut-il devenir générateur?", pourrait-il déclencher son rêve; si tel était le cas nous serions collaboratif de la création de dieu et de son rêve inhumain.
Bonjour,
je ne connais pas grand chose à la bioinformatique si ce n'est que mon compagnon vient de commencer cette formation en master, après une licence en biologie.
Malheureusement, ca ne se passe pas comme il le souhaitait, il a de très grosses difficultés à enregistrer la masse d'informations en informatique, il est complètement perdu à vrai dire... Ca fait 3 mois qu'il a commencé et il en est au point de se demander ce qu'il fait là..
J'entends de tt concernant la bioinformatique, dont beaucoup pensent qu'elle n'apporte que peu de débouchés aux étudiants qui la choisisse comme voie.
J'aurai aimé avoir l'opinion de gens étant passée par là ; je suis complètement néophyte dans les matières que sont la biologie et l'informatique (oui je surfe sur le net mais ça c 'est donné à tout le monde lol) et je ne sais pas quoi faire pour l'aider.
Doit il renoncer et dans ce cas que faire après une première année de master ? Y a t il encore possibilité de changer d'orientation?
Et sinon, etes vous vous aussi passé par la ? Les débuts ont ils été très durs aussi pour vous?
Il a en plus l'impression que même s'il finissait ce master, il ne serait pas pret a travailler et à faire ce qu'on attend d'un bioinformaticien par rapport aux cours donnés.
Toute sa classe est en difficulté et le seul à s'en sortir en informatique sort d'une licence info....
Enfin voila, si vous avez pris le temps de me lire jusque la, j'espère que vous aurez la gentillesse de me répondre,si vous avez votre opinion sur le sujet...
Merci.
Liloo.
Salut Liloo,
J'imagine que tu as lu www.biologeek.com/journal...
Concernant les difficultés en informatique, je dois avouer ne jamais avoir eu de probèmes de ce côté là. Et ce n'était pas le cas dans ma promotion non plus. Donc ça doit beaucoup dépendre des masters. Ce qui est intéressant, c'est qu'il aura un bon niveau en informatique s'il franchit le cap.
Le mieux pour s'en sortir est à mon avis de pratiquer. Je ne sais pas sur quoi est-ce qu'il butte mais si c'est Linux, il faut qu'il l'utilise quotidiennement, si c'est un langage particulier, il faut qu'il essaye de faire un projet perso l'utilisant, etc. Ce qu'on apprend à la fac n'est pas toujours le plus intéressant... j'ai l'impression d'avoir beaucoup plus appris en informatique avec mes activités réalisées en parallèle.
Maintenant, concernant son orientation, c'est à lui de voir. Mais il faut savoir que les premiers mois sont les plus difficiles. Donc s'il est motivé il peut tenir le coup. La seconde année de master est bien souvent une répétition de la première (enfin c'était mon cas) donc s'il passe la première année ça devrait être plus cool ;-).
Voila, j'espère vous avoir redonner un peu d'espoir/de motivation, courage ! Pour faire de la bioinfo, il faut avoir quelques bases techniques mais c'est loin d'être le plus important pour s'épanouir/être compétent.
Bonjour,
Je suis en L3 Biochimie moléculaire et cellulaire et j'envisage de faire un master Bioinformatique mais j'ai l'impression qu'il n'y a pas beaucoup de débouchés ? Est-ce vraiment le cas ?
Merci
bonsoir ,
je suis une étudiante en 3eme annee biotéchnologie végétale,et en ce moment je dois exposer dans quelques jours sur la bioinformatique ,mais là j'avoue que c'est une branche qui m'ai completement inconnue ,certe en lisant votre explication sur le thème je me suis un peu éclaircie les idees mais pour expliquer aux autres étudiants j'aimerai bien que vous m'aidiez un peu plus en me donnant plus d'explications et m'approfondir sur les domaines d'applications de cette science.
merci de bien vouloir me répondre!!!!!!!!!
lamia
Bonjour,
Je suis actuellement en terminal S option SVT, cela fait maintenant 3 ans, que je me tourne vers la bioinformatique comme futur orientation. Mais un problème se pose sur cette orientation, je ne suis presque sûr que d'une possibilité:
Licence de science du vivant puis plus tard spécialisation en bioinformatique.
Enfin bref l'orientation aprés bac en bioinformatique reste flou pour moi ou justement trop divers.
Pourriez vous m'aider à ce sujet? En m'indiquant si vous le savez la meilleur solution. Sachant que je n'est pas spécialement un trés bon dossier, j'ai même peur de devoir passer au ratrapage.
Merci d'avance.
Jérémy
salut je suis une etudiante en premiere anée maitrise en biotechnologie j'ai envie de poursuivre mes etudes en master bioinformatique mais j'ai peur de l'avenir de cette branche car les domaines de l'applications de la bioinformatique ne sont pas facilement trouvés surtout aux pays moins developpés comme le maroc et meme la formation ne sera pas efficace peut etre à cause de la manque des professeurs competentes dans ce domaines..etc . mais est ce que vous pensez que la vie a besoin de la bioinformatique?? et on peut faire quelque chose par ce decsipline??!!! meerccci bccp
Je vous conseille de lire l'ensemble de la catégorie Bio-informatique du site pour en savoir plus sur ce que j'en pense :-).
Bonjour,
Peut être y-a-t-il eu des commentaires à ce propos je n'ai pas tous lus (fin de journée oblige ;-) )
Un autre pendant de la bio-informatique que je trouve personnellement fascinant est la modélisation. La modélisation peut permettre de faire des prédictions (comme, exemple d'actualité, l'évolution du climat) ou simplement permettre d'expliquer comment un groupe de fourmis peut exploiter de manière optimale des sources alimentaire (travaux de JL Deneubourg). Je ne crois pas (suis pas un spécialiste de la question) que cette discipline soit très ancienne car il a fallu pour qu'elle se développe l'essor de l'informatique et surtout de la puissance de calcul de ceux-ci mais les gens qui en font arrivent à des choses déjà très intéressantes.
Bon allez j'arrête la ...
Je vais regardé ce site d'un peu plus prés (bio et info que du bonheur étant moi même un éthologiste (comportement animal) et nouvel ubuntero...)
A+ sur d'autre billet
Salut,
Ben alors, toi aussi tu as quitté la bio ?? je me souviens avoir écrit un commentaire sur ton blog en 2006 en rapport avec la bio-informatique. Ben figures-toi que j'ai aussi quitté la bio-informatique pour de l'informatique pure et dure (Linux, logiciels open source, ksh, perl, php, mysql,...)
Comme quoi ...
Ravie de t'avoir retrouvé par hasard sur le net :)
@+
Fatiha
moi,c'est la premiére fois que j'ai appris la notion de la bioinfo pra l'une de mes prof de bio mol et cela ma pris le cerveau et je suis a la recherche d'une bourse d'étude en cela.
Appel si qu'elle qu'un peu toute fois m'aide a en trouver une bourse.
merci
vincent
J'ai fait un stage au pôle Rhone-Alpes de BioInfo, c'était passionnant. Enfin j'aime les deux disciplines.
Par contre on se rend compte de la complexité du corps humain quand on voit les serveurs qu'il faut pour traiter certaines données...
je suis etudiant a l'universite de douala(cameroun)en bioinformatique et biostatisque.mon reve le plus cher en ce moment est de voir ce secteur d'activite se developper dans mon pays.pour le moment les choses sont un peu incertaine.
L'éthique c'est bien mais difficilement contrôlable...
dans les films c'est toujours un savant un peu fou financé par un magniat qui s'adonne à des expériences douteuses dans un labo à l'abri des regards
bizarrement ca paraît pas si improbable comme scénario ô_Ô